（一）辦公室。負責機關日常運轉，承擔文電、信息、宣傳、安全、機要、檔案、信訪、政務公開、行政后勤等工作；負責重要會議和活動的組織安排并督辦落實；負責重要文件、綜合性文稿起草和重大課題綜合調研工作；負責機關財務管理、資產管理和內部審計工作。負責機關及所屬事業單位的干部人事、機構編制、勞動工資、教育培訓等工作；負責機關及所屬事業單位人才隊伍建設，指導所屬事業單位的專業技術職務評聘工作；負責干部檔案管理工作；負責機關及所屬事業單位出國（境）人員審核報批工作；負責離退休干部工作。
（二）政策法規科。負責規范性文件的制定、審查，并對實施情況進行監督檢查；牽頭依法行政和法治建設工作；組織開展行政審批執法監督工作，負責有關行政許可決定的審核，牽頭組織行政許可決定撤銷工作；承擔聽證、行政復議、行政應訴等工作；負責相關業務法律法規的宣傳、執法人員培訓和管理工作；承擔行政權力清單的編制和調整工作；牽頭負責本局下放權力事項業務指導工作。
（三）行政審批制度改革科。負責研究提出全市“放管服”改革工作的政策措施，提出取消下放行政許可事項的意見；負責清理規范涉審中介服務、優化行政審批流程、推進“不見面審批（服務）”改革和“3550”改革工作，參與“證照分離”改革；承擔市政府推進職能轉變和“放管服”改革協調小組辦公室、市行政審批制度改革工作領導小組辦公室的日常工作。
（四）政務服務科。負責政務服務綜合協調、日常運行管理規范制定及業務指導工作，協助推進相關改革工作；負責政務服務體系建設，協調指導鎮（園區、街道）、村（社區）政務服務工作；負責對市各鎮（園區、街道）為民服務中心的日常巡查、考核工作。負責政務服務綜合標準化建設工作的推進實施；負責編制、實施政務服務綜合標準化建設工作的總體目標、中長期規劃和行動計劃；負責編制、貫徹和完善政務服務綜合標準體系，并對政務服務標準體系的運行情況進行督查考核；負責開展相關標準的基礎性研究；負責行政審批、政務服務相關規范標準的宣傳和培訓工作。
（五）業務指導科。承擔局行政審批制度改革的組織協調工作，研究提出局深化行政審批制度改革的措施及建議，對工作績效進行檢查評估；負責行政審批“三集中、三到位”工作的推進，對政務服務事項線上、線下運行進行指導、協調、監督、管理；負責牽頭建設項目全流程高效審批；指導協調審批業務的流程再造、聯合辦理、跟蹤服務；參與對實施行政審批涉及的中介服務行為進行監督；負責政務服務業務數據統計分析工作；負責重大項目、重點工程審批事項的任務分解；指導、管理和協調全市政務服務代辦幫辦工作。
（六）市場準入科。負責全市各類市場主體登記注冊工作；負責南通委托事項的承辦工作，負責食品經營許可，承擔限額以上或特殊行業外商投資企業設立、變更、解散、終止的審核轉報，承擔限額以下外商投資企業設立、變更、解散、終止審批的審核辦理；負責業務相關審批事項的現場核查和驗收工作；負責與業務關聯部門的銜接、溝通、協調等工作。
（七）綜合審批科。負責戶外廣告設置、電影放映單位設立、舉辦健身氣功活動、設立健身氣功活動站點的審批；負責民辦學校的設立、分立、合并變更、終止審批；負責互聯網上網服務營業場所經營單位申請從事互聯網上網服務經營活動、舉辦內地營業演出活動、內資娛樂場所申請從事娛樂場所經營活動、出版物零售單位設立變更、經營高危險性體育項目、煙花爆竹零售經營、危險化學品經營的許可；負責糧食收購資格認定；負責儲存煙花爆竹及金屬冶煉的建設項目安全設施設計審查；負責生產、經營易制毒化學品備案；負責撤銷以欺騙等不正當手段取得的娛樂經營許可證。負責組織業務相關的聯合踏勘、聯合竣工驗收等工作；負責與業務關聯部門的銜接、溝通、協調等工作；負責業務相關專家庫的建立與管理工作；協助業務相關中介服務機構的管理工作。
（八）投資管理科。負責權限內的政府投資項目審批與企業投資項目核準、備案；負責權限內建設項目環境影響評價文件審批和環境保護設施竣工驗收、市區夜間建筑施工許可；負責固定資產投資項目節能評估和審查；負責建設項目用地預審；承辦劃撥使用國有土地審查；負責做好綜合咨詢和預審服務推進工作；負責業務相關審批平臺應用推進工作；負責業務相關審批事項的現場核查和驗收工作；負責與業務關聯部門的銜接、溝通、協調等工作；負責業務相關專家庫的建立與管理工作；協助業務相關中介服務機構的管理工作。
（九）工程建設科。負責城市建筑垃圾處置核準，城市建筑垃圾處置費的征收，建設用地規劃許可證的核發，建設工程規劃類許可證核發，建設項目選址意見書的核發，鄉村建設工程規劃許可證的核發，規劃條件和規劃許可內容的核實，建筑工程施工許可證的發放，商品房預售許可，建設工程抗震設計審查，城鎮污水排入排水管網許可證核發，商品房現售備案，房屋建筑和市政基礎設施工程竣工驗收的備案，城市排水方案審批，城鎮排水與污水處理設施建設工程竣工驗收情況備案，城市綠化工程設計方案審批，綠化工程竣工驗收備案，人民防空工程竣工驗收備案，改造人民防空工程審批，城市地下空間開發利用兼顧人民防空要求的審批，城市及城市規劃區內新建民用建筑建設防空地下室審批，城市及城市規劃區內新建民用建筑確因地質等條件限制不能修建防空地下室審批，人防工程平時使用（開發利用）審批，房地產開發企業設立備案，房地產開發企業資質的核準初審，建筑業企業資質的核準初審；牽頭負責商業房產配套項目竣工聯合驗收工作；負責業務相關審批事項的現場核查和驗收工作；負責與業務關聯部門的銜接、溝通、協調等工作；協助業務相關中介服務機構的管理工作。
（十）公共資源交易管理科。擬訂公共資源交易管理制度，編制公共資源交易目錄，經批準后組織實施；制定實施公共資源交易管理相關細則和交易規則；負責對進入市公共資源交易平臺的交易活動進行現場監管，對本市交易平臺服務情況進行考核評價；負責公共資源交易活動相關投訴的協調指導和轉辦督辦；牽頭法律、法規、規章尚未明確監管部門的市級公共資源進場交易事項的監管；協調督促行業監管部門依法履行監管職責；管理評標（審）專家和招標（采購）代理機構，指導全市公共資源交易管理工作。
（十一）信息科。負責全市一體化在線政務服務平臺、“互聯網+監管”平臺的建設管理；負責擬訂全市政務服務信息化建設發展規劃、年度工作計劃及實施方案；開展全市政務服務“一張網”建設工作技術指導、業務培訓等工作；組織信息化項目的實施；負責管理考核信息化運維團隊；規劃統籌所屬事業單位信息化建設；協調市級相關部門對接政務服務信息化系統；指導鎮（園區、街道）政務服務信息化工作。
（十二）督查科。負責市政務服務大廳日常管理工作，負責對各進駐部門、單位的政務服務行為進行監督檢查，對窗口工作人員進行日常管理、教育培訓和監督考核；承擔政務服務大廳服務投訴受理、調查和處置工作；承擔審批服務群眾滿意度測評、群眾意見建議反饋和測評結果運用工作；會同有關科室推進政務服務綜合標準化建設和宣貫工作。組織開展黨風廉政建設和反腐敗工作，負責全面從嚴治黨兩個責任工作的落實和考核；做好全局廉政風險點的防控監督檢查；負責綜合績效考核管理工作。
機關黨總支。負責機關及所屬事業單位黨的建設工作。