市商務局設下列內設機構：
（一）辦公室（政策法規科）
（二）財務審計科
（三）市場運行和消費促進科
（四）流通與市場體系建設科（電子商務科）
（五）口岸管理科
（六）對外貿易科（服務貿易科）
（七）外國投資管理科（行政服務科）
（八）對外投資和經濟合作科
（九）安全生產監管科
